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伴隨診斷及其對檢驗醫(yī)學的影響

發(fā)布時間:2014-12-30 15:17:12     來源:檢驗世界網(wǎng)     點擊量:

Vijay Modur博士在2014AACC年會上進行了“Companion Diagnostics and Their Impact on Laboratory Medicine: A Glimpse of The Future”主題報告,Modur博士分析伴隨診斷變得重要的原因,總結技術和療法的進步,闡述基于證據(jù)的檢驗醫(yī)學在藥物開發(fā)創(chuàng)新的診斷作用,說明新藥物研發(fā)的患者選擇導至新型診斷測試的開發(fā)。

  在過去的十年中,一個主要的趨勢是開發(fā)新興療法成為發(fā)展個體化用藥的主要途徑。那伴隨診斷為什么變得如此重要呢?在這篇文章里我們將對這個問題進行一些歷史展望以便更好地進行將來的研究。

  一、伴隨診斷變得重要的原因
  以糖尿病為例(以下數(shù)據(jù)來自美國糖尿病協(xié)會),我們想要探究的是實驗室測試與最終開發(fā)療法之間的關系,以及療法是如何改變相應時代的治療狀況的。只需要注意上世紀中葉是如何開發(fā)糖尿病實驗室測試,進而由實驗室測試收集的大量數(shù)據(jù)得出糖尿病治療的藥物需求,就可以從中了解糖尿病治療,以及藥物的研發(fā)歷史(見表1)。現(xiàn)在人們已經(jīng)對糖尿病的發(fā)病頻率,以及如何治療糖尿病有了充分的了解。所有這些促使了Banting和Best發(fā)現(xiàn)胰島素,不久以后,從動物的胰腺提純的胰島素出現(xiàn),并用于糖尿病的治療。這就是實驗室測試為什么如此重要的原因。


  其他一些疾病也有類似的過程。從疾病的局部初始診斷,到研發(fā)出相應的療法,這之間以前基本上需要50年或更長。世人熟知Framingham的心臟病研究,這個研究發(fā)現(xiàn)膽固醇是心臟疾病的一個主要促進因素。從發(fā)現(xiàn)膽固醇到把膽固醇指標作為心臟病的診斷指標,再到發(fā)明他汀類藥物對誘發(fā)心臟疾病的膽固醇影響進行治療,這個過程要明顯短于糖尿病-胰島素這個過程。同樣,艾滋?。℉IV)-齊多夫定,丙型肝炎(HCV)-干擾素,以及非小細胞肺癌(NSCLC)-克里唑蒂尼才用了5年,這個過程被一再縮短(圖1)。從這些事實可以得出,實驗室測試發(fā)生創(chuàng)新緊接著就是新興療法的革新。實驗室測試的革新和新興療法的革新發(fā)生地越來越快,它們是同時發(fā)展進步的。臨床化學和臨床實驗室需要了解的很重要的一點是:新興療法的發(fā)展方向及其產(chǎn)生的影響是什么。


二、技術和療法的進步
緊跟時代和技術迅速發(fā)展的潮流,每天都有新的器械和技術出現(xiàn),如可以使某些測量工作與前幾年相比變得更準確,更經(jīng)濟,更迅速的技術。知識呈現(xiàn)爆炸性增長,我們發(fā)現(xiàn)自己被龐大信息量所吞沒。人類基因組計劃,以及該計劃的分支對新興療法的開發(fā)提出了新的目標。而且這兩者也在迅速的發(fā)展之中。測量DNA的技術以及DNA測序技術的發(fā)展令人十分驚奇。我們可以經(jīng)常聽到下一代測序和新生兒測序等技術,實際上,下一代測序是一項新技術,第一種這樣的設備已經(jīng)用于實驗室研究,在進行體外診斷之前,完成對某些疾病的初步診斷。


  歷史上曾出現(xiàn)過這樣的快速發(fā)展,在微生物學領域,對HIV的測試的發(fā)展就是明顯的例子,現(xiàn)在我們又有了其他的病毒測試板可供選擇,檢測同種病毒的可選測試板也增多了(圖3)。大量的新興技術正在出現(xiàn),對這些技術加以利用可以明顯改善和促進療法的研究和開發(fā)進程。


  技術的發(fā)展激發(fā)了期望的膨脹,許多期望不切實際,通過醒悟階段,回歸復蘇期再到穩(wěn)定產(chǎn)能高峰期,這個曲線會很大程度上對臨床實驗室產(chǎn)生影響。如果先前花費5-10年甚至更長開發(fā)一項實驗室測試,那么現(xiàn)在僅需耗時幾個月就能開發(fā)一項新測試。這不僅僅發(fā)生在實驗室內(nèi),從事相關研究的大學以及商業(yè)研發(fā)公司內(nèi)無時無刻不在發(fā)生這樣的變化。


  現(xiàn)在,我們要關注一下療法是如何開發(fā)的,療法的目標是什么以及它對檢驗醫(yī)學將會產(chǎn)生什么影響。以伊馬替尼為例(圖4),伊馬替尼是靶向療法的先驅(qū)。柱狀圖顯示伊馬替尼是如何在腫瘤部位實施靶向治療,以及在非腫瘤區(qū)域是如何發(fā)揮作用的。60年代,基因?qū)W有了長足進步,分析出慢性髓細胞性白血病(CML)的病因是:CML 9號染色體長臂C-ABL原癌基因易位至22號染色體長臂的斷裂點簇集區(qū)(BCR)形成BCR-ABL融合基因。融合基因?qū)е羈cr-abl,bcr-abl組成激酶,當激酶被激活,就能導至慢性髓細胞性白血?。–ML)。因此,抑制bcr-abl就有可能抑制疾病的產(chǎn)生和發(fā)展。在過去的5年中,如果能及早地明確這個原因進行治療,患者就很有可能治愈。


  當對靶向療法進行測試的時候會發(fā)生什么呢?當使用藥物的時候,需要在進入人體前進行臨床前試驗。藥物在進入人體前,需面臨兩項挑戰(zhàn):第一:正確的劑量是什么,在個體化用藥時會不會發(fā)生藥物過早分解?個體化用藥成功的關鍵點是使用正確的劑量對患者進行治療;第二,如何選擇正確的患者?當這兩項挑戰(zhàn)一而再再而三地重復出現(xiàn)時,會導至兩個問題:1 藥物是否作用于目標? 2 是否對正確的患者進行了治療?這些問題今天已經(jīng)由基于證據(jù)的檢驗醫(yī)學進行了解答。這就是在早期的藥物開發(fā)過程,個體化用藥和個體化用藥方法的起源,現(xiàn)在的藥物則和診斷緊密相聯(lián)。


  三、基于證據(jù)的檢驗醫(yī)學在藥物開發(fā)中創(chuàng)立新的診斷工具

  這就是如何創(chuàng)立新的診斷工具的方法,接下來我們要通過范例了解這個過程在過去是如何進行的,以及對未來的一些展望。如果將基于證據(jù)的檢驗醫(yī)學作為開發(fā)一種新試驗的第一步,我們就要經(jīng)歷這一步,我們需要知道這個試驗的基本特征,樣品類型,時間和樣品處理來建立試驗的有效性,接著了解臨床前和臨床環(huán)境數(shù)據(jù),生成臨床信息以及如何解析患者試驗數(shù)據(jù)。當觀察藥物的開發(fā)過程時,這項工作在階段I之前,在生成一個金字塔形之前非常適用(圖5)。尤其是尚在進行大量的動物試驗的時期,這項工作能提供試驗發(fā)揮作用的原理證據(jù)和模擬系統(tǒng)中試驗的最佳性能特點。接下來我們可以在階段I/II的臨床試驗中,在臨床前和臨床環(huán)境中生成數(shù)據(jù),接著在階段II/III或階段III后期臨床解析中生成數(shù)據(jù)。所有這些就是基于證據(jù)的,藥物開發(fā)的邏輯步驟。


  請看這個比較早的例子(圖6):這是阿侖膦酸鈉和二膦酸鹽相比,阿侖膦酸鈉用于預防骨軟骨病。阿侖膦酸鈉基于二膦酸鹽,作用于破骨細胞。抑制破骨細胞破壞骨骼,保護骨骼免受損傷。當開發(fā)阿侖膦酸鈉的時候,出現(xiàn)了一個大問題。先前的療法,在先前療法的基礎上,阿侖膦酸鈉產(chǎn)生前骨再吸收抑制劑,膦酸鹽導至了骨軟化,這與預期的效果完全相反。這是不可接受的,不能讓藥物導至骨軟骨病。當開發(fā)阿侖膦酸鈉,研發(fā)人員了解其優(yōu)于先前的藥物,但重要的是如何顯示更佳的療效呢。所以在阿侖膦酸鈉的開發(fā)期間,藥物研發(fā)團隊不得不通過多種方法展示阿侖膦酸鈉具有增加骨密度的功效。他們的所作所為其實是實驗室內(nèi)的工作,指標是uNTx和肌酸酐率。試驗的原理是:如果在羥脯氨酸交聯(lián)的交鏈末端使用端肽,在端肽的一端測量羥脯氨酸交鏈。這是一項uNTx試驗。當在臨床試驗中對阿侖膦酸鈉使用uNTx試驗時,看底線百分比的改變情況。在安慰劑試驗中,uNTx的水平改變并不大。當使用阿侖膦酸鈉后,uNTx的水平降低了,說明骨骼不再被吸收。將這些數(shù)據(jù)與骨骼密度數(shù)據(jù)聯(lián)合使用,就能體現(xiàn)藥物的作用。在以前這是用于藥物開發(fā)的試驗,現(xiàn)在則用于臨床試驗。


  uNTx臨床應用,使用芳香酶抑制劑治療的乳腺癌患者的骨密度(BMD結果)。骨密度高的患者有三種類型:骨骼密度極低的患者,醫(yī)師需要開始使用阿侖膦酸鈉或增加劑量,骨密度適中的患者,醫(yī)師需要測量NTx,根據(jù)NTx水平?jīng)Q定是否使用阿侖膦酸鈉或者其他藥物,還有許多其他類的阿侖膦酸鈉藥物。這就是一個以前用于藥物研發(fā)而現(xiàn)在卻用于臨床的試驗的范例。

  回到BCR-ABL的話題,因為這是一個頗具挑戰(zhàn)性的話題。作者花費大量的時間對其進行研究。許多和患有CML患者相關的試驗,當然,對這些患者也進行基因?qū)W試驗。血液中的Bcr-abl的轉(zhuǎn)錄本水平,是這種疾病的疾病負擔的良好指標。對疾病負擔進行監(jiān)視,能夠得出患者是否對療法有反應。我們對bcr-abl做出的任何處置可以視為使其通過臨床試驗的活動,使其與探究性的生物標志物融合。在這項試驗中,我們每隔3-6個月對參與試驗的每個患者進行了采血,適于進行bcr-abl監(jiān)視(圖7)。我們發(fā)現(xiàn)患者的bcr-abl水平可用于測定患者反應。這是每個實驗室都可能進行的商業(yè)試驗之一。


  這項實驗能夠成為商業(yè)性試驗的證據(jù)是24個月的跟蹤隨訪信息。如果患者的bcr-abl比率小于0.1,他們將會有非常好的預后。如果bcr-abl率高于0.1,那么這個比率越高,預后就會越差。這個測試當今在臨床領域的應用是在:一年內(nèi),bcr-abl率未達到0.1以下或者比0.1更高的患者。這些患者必須使用有效的bcr-abl抑制劑。

  表2為從生物標志物發(fā)展而來并用于臨床試驗的診斷測試,這些大都為不同的藥物試驗得來的診斷范例,接著我們通過給出的不同監(jiān)視試驗的范例討論的是什么形成了伴隨診斷。


  四、新藥物研發(fā)的患者選擇導至新型診斷測試的開發(fā)
  藥物開發(fā)中的第二個最重要的問題就是患者的選擇。在這個范例中,首先討論的是癌癥。癌癥治療面臨的問題是患者目標療法的鑒別是很復雜的。這是一個黑色素瘤(圖8),如果仔細觀察小視圖中的黑色素瘤,好多人都會說:“嘿,我有這種突變,應該用這種方法治療!”于是活組織檢查被送交到測序試驗。根據(jù)黑色素瘤類型的不同確定不同的療法。對于罕見的黑色素瘤,罕見類型所占的比例大概為5%,就不能按照常見類型的療法進行治療。如果按照常見類型的療法對患者進行治療,就會產(chǎn)生用藥錯誤。因此我們進行小鼠雜交瘤細胞試驗(BRAF),確定BRAF突變要求的患者選擇。


  抗BRAF的第一種藥物被證明是維羅非尼,當其在患者中應用對抗BRAF 突變時,也用于與達卡巴嗪做比較(圖9)。作為BRAF的抑制劑,其非常地有效。使用靶向療法的一個問題是,隨著時間的推移,患者對這種療法會產(chǎn)生抗性。產(chǎn)生抗性對于藥品的開發(fā)是一個機會。因為出現(xiàn)抗藥性意味著出現(xiàn)了新的突變。對于出現(xiàn)了抗藥性的患者可采用二線或三線的抑制劑繼續(xù)治療?;颊邔Ο煼óa(chǎn)生反應,緊接著就是藥物的快速發(fā)展,這與伴隨診斷并不矛盾。

  通過簡單的例子展示藥物與診斷之間的反饋環(huán)(表3),許多類型的實驗室測試,可以是藥物開發(fā)的一部分,或者促進藥物的開發(fā)。以已給出的疾病監(jiān)視試驗為例:其可以使患者受益,亦可使新興療法的開發(fā)受益??顾幮詷酥疚飳Ο煼ǖ那袚Q有益,當然大多數(shù)人已經(jīng)具有藥物抗藥性標志物監(jiān)視,這也對新興藥品的開發(fā)有益。出于對藥物的安全性,有效性和適用性的考慮,藥物開發(fā)對療法和抗藥性有要求。早期診斷已經(jīng)成為熱議的話題,許多異構體疾病具有較長潛伏期和發(fā)展期,需要在其癥狀顯露前好多年進行早期診斷。Eli lilly公司致力于發(fā)展異構體疾病藥物。但是診斷單位懷疑淀粉樣蛋白是否具有在早期診斷疾病的能力。現(xiàn)在,受到藥物開發(fā)的影響,大力推進早期診斷測試成為一種潮流。

  通過新興療法的不斷發(fā)展,取得新的診斷方法。奠定基礎的是生物標志物的效果。藥物的研發(fā)任重而道遠。先要通過系統(tǒng)的生物標志物途徑,得到正確的方法-患者選擇,劑量和計劃,進行個體化用藥。接著是療法診斷工具,找到正確的患者,監(jiān)視療法的實施,通過抗藥性測試和其他實驗室測試進行預后和風險分類。

  當藥物的開發(fā)和新興診斷方法變得如此接近,周期如此之短的時候,診斷機會被分成了兩部分。一部分是伴隨診斷:藥物-診斷流程和組合對藥物的成功提出更多要求,要達到藥物-診斷市場準入的目的,藥物開發(fā)和診斷團隊之間必須具有高度的協(xié)調(diào)性;另一部分是疾病標志物:未發(fā)現(xiàn)的新型疾病子集,風險預測和監(jiān)視以及基于證據(jù)的患者管理中的疾病標志物輔助。